Большинство религиозных сооружений в СССР переживали сложный период в советское время, многие были целенаправленно разрушены, другим повезло и их помещениям нашлось другое целевое применение, таким образом они были спасены от уничтожения.
Римско-католический костёл в Иркутске в рамках антирелигиозной кампании в 1938 г. был закрыт (как и многие другие храмы), здание национализировано и передано под светские нужды.
С 1940-х по 1970-е гг. здесь размещались:
- Кинотеатр «Полярная звезда»;
- Концертный зал (с 1950-х гг.);
- Складские помещения.
Из-за отсутствия должного ухода здание ветшало. Часть витражей была утрачена, интерьеры повреждены (алтарь, орган, росписи), деревянные элементы (скамьи, хоры) частично разобраны или уничтожены.
В 1970-е годы костёл, как и многие другие культовые сооружения, оказался под угрозой сноса. Однако благодаря усилиям местной интеллигенции и польской общины здание поставили на охрану как памятник архитектуры.
В 1978 году началась реставрация здания, а в 1980-м его передали Иркутской филармонии.
В 1990 году костёл вернули католической общине, и он снова стал действующим храмом.
В здании сохранились следы советского периода:
- Некоторые переделки интерьера (например, сцена вместо алтаря в филармонический период).
- Утрата части оригинального убранства (но основные неоготические элементы сохранились).